Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTPBP6O43824 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP6O43824 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTPBP6O43824 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTPBP6O43824 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTPBP6O43824 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTPBP6O43824 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms