Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2LO15068 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2LO15068 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCF2LO15068 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms