Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
CHD1O14646 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CHD1O14646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CHD1O14646 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CHD1O14646 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CHD1O14646 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CHD1O14646 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CHD1O14646 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CHD1O14646 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CHD1O14646 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CHD1O14646 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CHD1O14646 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.47
CHD1O14646 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CHD1O14646 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CHD1O14646 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43■■■■■ 4.47
CHD1O14646 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CHD1O14646 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CHD1O14646 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CHD1O14646 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CHD1O14646 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CHD1O14646 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CHD1O14646 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CHD1O14646 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CHD1O14646 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CHD1O14646 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CHD1O14646 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CHD1O14646 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CHD1O14646 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CHD1O14646 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CHD1O14646 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CHD1O14646 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CHD1O14646 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHD1O14646 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHD1O14646 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHD1O14646 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CHD1O14646 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CHD1O14646 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CHD1O14646 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CHD1O14646 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CHD1O14646 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CHD1O14646 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CHD1O14646 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHD1O14646 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHD1O14646 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHD1O14646 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHD1O14646 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHD1O14646 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHD1O14646 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHD1O14646 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHD1O14646 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CHD1O14646 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CHD1O14646 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.82■■■■■ 4.44
CHD1O14646 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CHD1O14646 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CHD1O14646 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CHD1O14646 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHD1O14646 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHD1O14646 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CHD1O14646 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CHD1O14646 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CHD1O14646 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CHD1O14646 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
CHD1O14646 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CHD1O14646 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CHD1O14646 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CHD1O14646 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CHD1O14646 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHD1O14646 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHD1O14646 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHD1O14646 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CHD1O14646 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CHD1O14646 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CHD1O14646 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CHD1O14646 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CHD1O14646 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHD1O14646 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHD1O14646 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CHD1O14646 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CHD1O14646 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHD1O14646 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
CHD1O14646 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHD1O14646 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CHD1O14646 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CHD1O14646 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CHD1O14646 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
CHD1O14646 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
CHD1O14646 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CHD1O14646 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CHD1O14646 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CHD1O14646 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CHD1O14646 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CHD1O14646 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms