Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms