Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP99D6REC4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP99D6REC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP99D6REC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP99D6REC4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms