Protein–RNA interactions for Protein: B2RTY4

MYO9A, Unconventional myosin-IXa, humanhuman

Predictions only

Length 2,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9AB2RTY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYO9AB2RTY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYO9AB2RTY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYO9AB2RTY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYO9AB2RTY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms