Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT1A5YKK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT1A5YKK6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT1A5YKK6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT1A5YKK6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms