Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SGCZQ96LD1 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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