Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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AP3B2Q13367 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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AP3B2Q13367 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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AP3B2Q13367 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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AP3B2Q13367 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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AP3B2Q13367 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
AP3B2Q13367 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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