Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 ZNF30-204ENST00000601142 2280 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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