Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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