Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CTLA4-204ENST00000472206 277 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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