Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CEP290O15078 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CEP290O15078 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms