Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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