Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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