Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LAMA3Q16787 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LAMA3Q16787 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LAMA3Q16787 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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