Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms