Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CENPFP49454 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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