Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.169-201ENST00000613708 283 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SP140-201ENST00000343805 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ZNF449-202ENST00000370761 2051 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MAP3K7CL-208ENST00000399935 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ALG13-204ENST00000436609 3812 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NOS1-203ENST00000344089 4340 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MAGOHB-201ENST00000320756 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TCF4-224ENST00000564403 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SNX20-203ENST00000423026 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TP63-210ENST00000440651 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CBFA2T2-210ENST00000543126 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC103563.8-201ENST00000415716 318 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC004448.4-209ENST00000421796 684 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CHCHD4P2-201ENST00000431135 420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RN7SL754P-201ENST00000470784 266 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 PTPRE-207ENST00000471218 522 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AP003064.2-201ENST00000528983 510 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AP000820.1-201ENST00000545912 506 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MCM3AP-AS1-201ENST00000414659 2539 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SH2D4B-202ENST00000339284 3983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MRAS-210ENST00000614350 4377 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 MIR296-201ENST00000385215 80 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 AC010967.3-201ENST00000438648 213 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CACNB1Q02641 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms