Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC136619.1-201ENST00000564015 258 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL133351.4-201ENST00000604204 631 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ATP5HP4-201ENST00000414313 475 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC02090-201ENST00000419151 400 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL355863.1-201ENST00000424331 293 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MTAPP2-201ENST00000437063 832 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL050402.1-201ENST00000440477 770 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ENPP7P2-201ENST00000462675 943 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 HP-207ENST00000562526 685 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXB1P14653 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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