Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MIS18AQ9NYP9 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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