Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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