Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PSMD6Q15008 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms