Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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COL4A6Q14031 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
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