Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 AC113355.1-201ENST00000510512 491 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 IGHV3-36-201ENST00000520848 401 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MIR4440-201ENST00000583986 98 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 GAD1-217ENST00000625689 3700 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 ZP4-202ENST00000611898 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CFAP45-202ENST00000426543 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 OR11A1-201ENST00000377147 2229 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 SEC14L3-203ENST00000402286 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 LINC01654-201ENST00000569711 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DCTN2-209ENST00000548249 2061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 PRUNE1-201ENST00000271620 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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