Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084866.1-201ENST00000508955 554 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008429.3-201ENST00000519755 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010768.1-201ENST00000533814 543 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL10P13-201ENST00000550757 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NT5CP2-201ENST00000553305 561 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01579-203ENST00000555023 400 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357153.2-201ENST00000556646 565 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL353P-201ENST00000579902 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBBP4-201ENST00000583708 689 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020663.1-201ENST00000588099 556 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007128.2-202ENST00000606016 543 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026355.3-201ENST00000611065 727 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC121758.3-201ENST00000611595 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024288.1-201ENST00000613682 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099518.6-201ENST00000617407 450 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 GGNBP1-206ENST00000618642 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359644.1-201ENST00000635872 471 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AASS-202ENST00000393376 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 KATNAL2-201ENST00000245121 2833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC134508.1-201ENST00000570082 2977 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNKSR2-201ENST00000279451 4478 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009090.4-201ENST00000623921 3691 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00877-203ENST00000468646 2506 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01001-203ENST00000607448 1569 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTUD6B-205ENST00000615618 3434 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PXYLP1-202ENST00000393010 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms