Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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