Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRHP20396 DLGAP1-AS2-201ENST00000572856 2261 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRHP20396 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRHP20396 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRHP20396 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRHP20396 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 VPS45-202ENST00000369130 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 ARL11-201ENST00000282026 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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