Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N7

ROBO1, Roundabout homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1Q9Y6N7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO1Q9Y6N7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO1Q9Y6N7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms