Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms