Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms