Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD2APQ9Y5K6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms