Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms