Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms