Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP22Q9UPT9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms