Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms