Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP18Q9UMW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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