Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED23Q9ULK4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms