Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2AQ9ULE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms