Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXL4Q9UKA2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXL4Q9UKA2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms