Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAI1Q9UI46 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms