Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms