Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APEX2Q9UBZ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms