Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP35Q9P2H5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP35Q9P2H5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
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