Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms