Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZDHHC3Q9NYG2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZDHHC3Q9NYG2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms