Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms