Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms