Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms