Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms